Protein–RNA interactions for Protein: B1ARV6

Pramef20, PRAME family member 20, mousemouse

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef20B1ARV6 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pramef20B1ARV6 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pramef20B1ARV6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Pramef20B1ARV6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Pramef20B1ARV6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms