Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Tmem238A9JSM3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms