Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Atp8b5A3FIN4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atp8b5A3FIN4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Atp8b5A3FIN4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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