Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SetxA2AKX3 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SetxA2AKX3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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