Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Lcn6A2AJB9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lcn6A2AJB9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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