Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Prdm12A2AJ77 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Prdm12A2AJ77 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms