Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Frmpd4A2AFR3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms