Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col9a3A2ACT7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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