Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbbp8nlA2ABX0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms