Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Shisal2aA2A9G7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms