Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prdm16A2A935 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prdm16A2A935 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms