Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef6A2A8M8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef6A2A8M8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pramef6A2A8M8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pramef6A2A8M8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pramef6A2A8M8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pramef6A2A8M8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms