Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
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