Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5I2

Trbv4, T cell receptor beta, variable 10 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv4A0A075B5I2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv4A0A075B5I2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv4A0A075B5I2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv4A0A075B5I2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv4A0A075B5I2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trbv4A0A075B5I2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trbv4A0A075B5I2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trbv4A0A075B5I2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms