Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vmn2r25W4VSP2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms