Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Hdac6Q9Z2V5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Hdac6Q9Z2V5 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Hdac6Q9Z2V5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Hdac6Q9Z2V5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Hdac6Q9Z2V5 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Hdac6Q9Z2V5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Hdac6Q9Z2V5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hdac6Q9Z2V5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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