Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccne2Q9Z238 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccne2Q9Z238 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms