Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RfxankQ9Z205 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RfxankQ9Z205 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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