Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
VarsQ9Z1Q9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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VarsQ9Z1Q9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
VarsQ9Z1Q9 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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