Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cacna2d3Q9Z1L5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms