Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Skp2Q9Z0Z3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms