Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gipc1Q9Z0G0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gipc1Q9Z0G0 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gipc1Q9Z0G0 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gipc1Q9Z0G0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gipc1Q9Z0G0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gipc1Q9Z0G0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gipc1Q9Z0G0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gipc1Q9Z0G0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms