Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

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Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
AireQ9Z0E3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
AireQ9Z0E3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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