Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Trim10Q9WUH5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Trim10Q9WUH5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trim10Q9WUH5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms