Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp18Q9WTV6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Usp18Q9WTV6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms