Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trpc2Q9R244 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms