Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TapbpQ9R233 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms