Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NrkQ9R0G8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NrkQ9R0G8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms