Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Plod1Q9R0E2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms