Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf4Q9QZS2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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