Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Usp21Q9QZL6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Usp21Q9QZL6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms