Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ubxn8Q9QZ49 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ubxn8Q9QZ49 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms