Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phtf1Q9QZ09 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms