Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Irx4Q9QY61 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms