Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pdzd4Q9QY39 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms