Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp3Q9QY23 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms