Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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Kcnip3Q9QXT8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Kcnip3Q9QXT8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
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