Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rad18Q9QXK2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rad18Q9QXK2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms