Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Limd1Q9QXD8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms