Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Homer2Q9QWW1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms