Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PdcQ9QW08 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdcQ9QW08 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdcQ9QW08 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdcQ9QW08 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdcQ9QW08 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PdcQ9QW08 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PdcQ9QW08 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms