Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Msh5Q9QUM7 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 2810404M03Rik-201ENSMUST00000188324 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Msh5Q9QUM7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms