Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tnfrsf19Q9JLL3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms