Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
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Col5a3Q9JLI2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Col5a3Q9JLI2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Col5a3Q9JLI2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms