Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Tlr5Q9JLF7 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tlr5Q9JLF7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tlr5Q9JLF7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms