Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CtsmQ9JL96 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CtsmQ9JL96 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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