Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX4

Aatf, Protein AATF, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AatfQ9JKX4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AatfQ9JKX4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms