Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Scamp4Q9JKV5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms