Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mrpl39Q9JKF7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Mrpl39Q9JKF7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mrpl39Q9JKF7 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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