Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Nectin1Q9JKF6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Nectin1Q9JKF6 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms